Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms