Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms