Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms