Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT6BP04259 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms