Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCATO75600 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms