Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF10O60809 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PRAMEF10O60809 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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