Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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