Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUSKO15146 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUSKO15146 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUSKO15146 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUSKO15146 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUSKO15146 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUSKO15146 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUSKO15146 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUSKO15146 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUSKO15146 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUSKO15146 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUSKO15146 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUSKO15146 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUSKO15146 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms