Protein–RNA interactions for Protein: O14526

FCHO1, F-BAR domain only protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1O14526 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FCHO1O14526 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms