Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms