Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms