Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms