Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
V9GY48 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V9GY48 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V9GY48 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V9GY48 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms