Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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