Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms