Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms