Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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