Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TBCCD1Q9NVR7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TBCCD1Q9NVR7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TBCCD1Q9NVR7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TBCCD1Q9NVR7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TBCCD1Q9NVR7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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