Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms