Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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SNX15Q9NRS6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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SNX15Q9NRS6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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