Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms