Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms