Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms