Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms