Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms