Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms