Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms