Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms