Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms