Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms