Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms