Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf72Q96LT7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms