Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms