Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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