Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms