Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms