Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms