Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GDPD1Q8N9F7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms