Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms