Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF39Q8N4T4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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