Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TRAPPC6BQ86SZ2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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