Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms