Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms