Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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