Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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LINC00299Q6ZSB3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LINC00299Q6ZSB3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LINC00299Q6ZSB3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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