Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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