Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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