Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms