Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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