Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NTRK3Q16288 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NTRK3Q16288 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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